小儿腮腺炎是因为病毒感染所致，目前并没有针对性的抗病毒药物，临床上主要采取对症治疗来缓解患儿的不适，预防并发症。比如在患儿出现高热时，可以口服对乙酰氨基酚来降温，或在中医指导下服用黄岑口服液、板蓝根颗粒和普济消毒饮等清热解毒的中药。
1、广谱抗病毒药
虽然小儿腮腺炎没有特异性的治疗药物，但对于部分病毒感染较重的患儿，可考虑使用广谱强效的抗病毒药物，如利巴韦林口服液。滥用利巴韦林容易引起不良反应，因此一定要在医师严格指导下使用。对于应用干扰素治疗此病，目前尚有争论，并没有得到广泛认可。
2、中药
中药治疗小儿腮腺炎是一种行之有效的方法。比如清开灵颗粒、黄岑口服液、板蓝根颗粒和普济消毒饮等中成药或方剂，既可以清热解毒，缓解患儿的发热、咽痛、头痛等不适症状;而且部分中药也可以帮助对抗病毒感染。但中药需在中医辨证论治基础上使用，也不可随意用药。
3、其它
在小儿出现高热头痛等不适症状时，还可在医师指导下，使用对乙酰氨基酚等解热镇痛药;患儿并发严重的睾丸炎症时，可以在短期内应用氢化可的松等糖皮质激素来减轻炎症反应。患儿并发脑膜炎时，如出现颅内压增高，还需应用降颅内压药物。患儿并发胰腺炎时，需应用抗生素防治细菌感染。
