轮状病毒感染引起的腹泻没有特殊的药物治疗，目前在临床上主要是应用益生菌制剂和肠粘膜保护剂来缓解症状，同时也通过补液盐和静脉输液等措施来纠正水电解质紊乱。轮状病毒腹泻是一种自限性疾病，患儿在合理治疗的基础上可以快速恢复。
1、肠粘膜保护剂
对于轮状病毒感染引起的腹泻，可以适当应用肠粘膜保护剂，也就是蒙脱石散，其用量需要根据孩子腹泻的具体情况来调整。蒙脱石散的主要成分是蒙脱石微颗粒，对胃肠粘膜有较强的覆盖保护能力，而且不进入血液循环，比较安全。不建议使用其它止泻药，以免增加肠道对毒素的吸收，增加风险。
2、益生菌制剂
使用益生菌制剂主要是为了防止腹泻引起肠道菌群紊乱，同时也可以调节肠道内的微生态，对腹泻起到一定的缓解作用，比如培菲康、妈咪爱、双歧杆菌乳杆菌三联活菌片等。
3、补液盐
补液盐的主要成分为葡萄糖、氯化钠、氯化钾，主要用于补充患儿过度流失的液体。轮状病毒感染的患儿可以口服补液盐来预防或纠正轻度的脱水和电解质紊乱。如果水电解紊乱的状况比较严重，出现了明显的脱水和酸中毒，则要通过静脉输液的方式来纠正。
