沐舒坦的不良反应主要为消化道的不适，比如胃部灼热、恶心呕吐、消化不良、食欲差、腹泻和腹痛等，还有皮疹、水肿、痛痒和荨麻疹等过敏反应。当然，按照正确的用法用量来使用，不良反应的出现率并不高，患者不必过于担心。
沐舒坦的有效成分是盐酸氨溴索，这种物质可以有效溶解痰液，促进痰液稀释并排出，并抑制过多痰液的产生，因此沐舒坦常用于呼吸道疾病患者的祛痰之用。临床上使用沐舒坦进行治疗，主要是有胃部不良反应的报道，比如胃部灼热、恶心呕吐、消化不良、食欲差、腹泻和腹痛等，偶尔会有对此药过敏的患者出现皮疹、瘙痒和水肿等不良反应。
一般来说，沐舒坦只要在医师指导下按照正确的用法用量来服用，是比较安全的，一般不建议超过1周，症状未能缓解必须及时就诊，长期使用出现不良反应的几率会增高。对于肝肾功能有损害的患者、孕妇、哺乳期妇女以及1岁以下的婴儿需要慎用此药，具体用药情况需就医才能明确。已经明确会对此药过敏的患者禁止使用。
另外，由于沐舒坦仅对咳痰不利的症状有一定作用，在具体治疗时，不可以与异米尼尔、右美沙芬等强效镇咳药物一起使用，因为咳嗽本身可以排痰，如果随意止咳，会让稀释的痰液堵塞呼吸道，具有一定的危险性。还有，在服药期间出现皮肤病变的情况下，为保险起见，不宜继续使用沐舒坦，需及时就诊。
