肾脓肿在大部分情况下，可以被完全治愈。肾脓肿的治疗主要以药物治疗和手术治疗为主。如果患者的肾脓肿在3厘米以下，可以采用抗生素治疗;如果患者药物治疗不理想，那么就可以采取手术治疗。手术治疗的方案主要根据患者的情况来判断。
肾积脓属于泌尿系统感染的并发症。有致病菌和传播途径，通过采取不同的治疗方法，绝大多数得以治愈。肾脓肿常常发生于有糖尿病，尿路梗阻，尿路结石，泌尿系结核等复杂性尿路感染，以及全身存在感染灶的患者，由于肾积脓会压迫肾实质、导致肾功能损伤，就需要尽快治疗。
在治疗方面，如果患者的脓肿比较小，在3cm以下，可以采用保守治疗，静脉使用抗生素，常用的是氨基糖甙类和头孢菌素类;考虑球菌感染，可以用万古霉素和阿奇霉素。
如果药物治疗以后，患者的治疗效果不理想，还存在局部疼痛的症状时，就需要进行外科治疗，包括穿刺引流和手术切开。手术切开的目的是使脓液尽快流出，缓解对肾脏的压力，修复肾功能。在手术以后，患者还需要服用3到5天的抗生素。
