萎缩性胃炎如果是因为幽门螺旋杆菌感染导致的，那么就要采用四联疗法进行治疗。除此之外，萎缩性胃炎的用药主要以促进胃动力、综合胆汁、保护胃黏膜、抑制胃酸分泌为主，常用的药物有吗丁啉、莫沙必利、去氧胆酸、硫糖铝、前列腺素E等。
如果患者的萎缩性胃炎是因为幽门螺旋杆菌感染导致的，那么一般采用四联疗法进行治疗，四联疗法分别是两种抗生素、一种抑酸剂、一种铋剂。
如果患者的萎缩性胃炎是因为胆汁反流导致的，那么要服用促胃动力的药物以及综合胆汁的药物。促进胃动力能够避免胆汁反流。在临床上常用的促胃动力药物有吗丁啉、莫沙必利，综合胆汁的药物有去氧胆酸。
萎缩性胃炎还要停止对胃黏膜的损伤，保护胃黏膜，避免继续受到损伤，抑制胃酸的分泌。在临床上，常用的胃黏膜保护剂有硫糖铝、前列腺素E，抑制胃酸的药物有硫糖铝、铝碳酸镁片等。如果想要使用药物，那么要尽量避免使用损伤胃黏膜的药物，比如阿司匹林、消炎痛等。
