胶囊肠镜和普通肠镜的区别主要在于诊断方法以及作用上。普通肠镜通过把肠镜送到肠道进行观察，而胶囊肠镜自动拍摄;在作用方面，胶囊肠镜只能用于诊断，而普通肠镜不仅能够进行病情诊断，还可以取组织进行病理检查，甚至治疗部分肠道疾病。
普通肠镜能够良好的对患者身体内部的情况来进行检查。对于患者来说，若是肠部出现便血症状或是有强烈的疼痛感，就说明患者的肠部可能有病变部位，甚至病变部位有发炎的可能。但肠部很难通过直观的方式来进行观察，因此使用肠镜可以将患者肠部内部的情况良好的展现出来。
胶囊肠镜的大小跟普通的胶囊差不多，胶囊内镜属于无创的操作。在吞服胶囊以后，胶囊就随着胃肠道的正常蠕动，在体内进行翻转、运转，可以同时的摄下包括食道、胃、小肠、大肠的图片，等一定时间后，就可以形成一个完整的胶囊内镜的图片。
胶囊肠镜和普通肠镜的区别主要在于普通肠镜要通过肛门把肠镜送到肠道进行观察，而胶囊肠镜自动拍摄;另外普通肠镜可以在肠镜下取组织进行病理学化验，而且可以在肠镜下进行治疗，而胶囊肠镜只能用于诊断。
