脚趾疼痛的原因主要包括非疾病因素和疾病因素这两大类。其中，非疾病因素包括长时间运动、锻炼时足部受力姿势不正确、鞋袜长期摩擦等;疾病因素包括趾甲嵌顿、脚趾部位的炎症等局部疾病以及痛风、类风湿性关节炎等全身性疾病。
如果患者近期换了新鞋，脚趾疼痛可能是单纯的鞋子过小、过硬的原因，在行走时，不合脚的鞋子会造成双脚受力异常，进而引起脚趾发红、疼痛，在换上宽松的鞋子并适当休息后，疼痛会得到缓解。
如果患者脚趾甲长时间不修剪，可能会长进肉里，这种趾甲嵌顿也可以导致脚趾疼痛。如果甲床受到微小的创伤后，因不注意卫生而发生细菌感染，还可能会形成甲沟炎，使脚趾甲周组织发红、肿痛，严重者可能会出现化脓现象。
如果脚趾的一个或多个小关节处突发肿胀和疼痛，甚至出现不规则的隆起的黄白色赘生物，考虑是痛风引起的。除了脚趾的第一跖趾关节，患者的耳廓、指关节等部位也可以出现大小不一的痛风结节。
另外，脚趾疼痛也可能是类风湿性关节炎的表现症状之一，这种自身免疫疾病以关节侵蚀为主要特征，早期也可以出现掌指关节、足趾关节肿胀、疼痛等症状。
